Bet Tzedek defiende los derechos de afirmación de género ofreciendo clínicas y representación directa para ayudar a personas con denegaciones de seguro médico y beneficios, discriminación en vivienda y empleo, y acceso a servicios públicos. También apoya a personas transgénero y no conformes con el género en la actualización de sus nombres legales y marcadores de género en documentos de identificación para que coincidan con su identidad de género.